根据《担保法》第34条第1款规定，抵押人所有的房屋和其他地上定着物，可以抵押。可见，农民以其宅基地上的房屋抵押应当是有效的。但《担保法》第37条第2款规定，耕地、宅基地等集体所有的土地使用权，不得抵押。