区别有以下几点：1、贷款利率不同对于申请者而言,最关心的是贷款利率。公积金的贷款利率比商业贷款利率低,五年以内公积金贷款利率为4.0%,五年以上是4.5%。而商业贷款利率五年以上贷款利率为6.55,不同银行所执行的贷款利率在这个基准利率之上有所浮动。2、贷款机构主体不同住房公积金贷款管理主体是住房公积金管理中心,而商业住房贷款管理主体是各商业银行。3、贷款的资金来源不同商业住房贷款资金来源是各商业银行的自营资金(即吸收的居民或单位存款),而住房公积金贷款资金来源是职工个人及所在单位缴存的住房公积金。“公转商”政策是为了缓解购房者的贷款压力，确保贷款资金的健康流动性，同时更好地支持和满足住房公积金缴存职工购房贷款需求。“公转商”贴息贷款按公积金贷款管理原则进行管理，申请人申请公转商记录为申请一次公积金贷款。　　与公积金贷款相比，公转商的最终下款方是银行，申请流程类似商贷，但税率和公积金贷款一样。公转商还款方式和商业贷款一样，还给银行。相同的是二者都需要符合公积金贷款资格，最高贷款额度和期限的计算方式也相同；办理的手续、材料和程序基本相同。